Иногда для тайных посланий используют книжный шифр. На сегодняшний день ученые и историки не имеют четкой информации о том, когда и кем первый раз был использован книжный шифр. Многие историки склоняются к тому, что родоначальником этого шифра, как и многих других, был Эней Тактик, ведь это был первый человек, создавший первое письменное произведение, в котором упоминалась криптография. Ранее уже говорили об книжном шифре Энея. А вот для этого книжного шифра необходимо, чтобы у обменивающихся была одна и та же книга в одном и том же издании (обязательно, чтобы на одних и тех же страницах книги был один и тот же текст).

  При пересылке сообщения отправитель открывает книгу на любой странице, отыскивает нужную буквы и записывает номер страницы, номер строчки и номер буквы в этой строке. Например, ему нужна буква «А», он наугад открыл книгу на 20 стр, увидел данную букву в пятой строке, она 3 по счету. Можно это записать так: «20-5-3», дальше описывает следующую буквы.
   Так как одна и та же буква шифруется, постоянно новым способом, то перехвативший сообщение не сможет подсчитать частоту, с которой встречается буква, но и расшифровать текст. Но и условие, шифр надежен до тех пор, пока книга, которую используют хранится в тайне. Вместо книги в качестве ключа можно, например использовать заученное наизусть стихотворение (но чтобы в нем были все буквы алфавита). В этом случае буквы стихотворения просто нумеруются по порядку.
 Например, если выбрать ключом стихотворение: 

«Зайку бросила хозяйка, под дождем остался зайка», то фамилию автора этого стихотворения можно зашифровать таким образом 6-2-7-31-8.

   Книжные шифры, а именно шифры, использующие в качестве кодового текста стихотворения, широко применялись революционерами в начале ХХ века[4]. Так в одной из тайных переписок, ключом шифра являлось стихотворение Н. А. Некрасова «Школьник». Однако одной из ошибок революционеров было частое использование произведений тех авторов демократов, которые были известны полиции. Это делало расшифровку засекреченных сообщений гораздо легче, поскольку сама идея шифрования была известна полиции. Защита была обеспечена лишь в том случае, когда ключом было «секретное стихотворение».
    Прославленный советский разведчик Рихард Зорге с успехом использовал книжный шифр. Японцы не смогли прочесть шифровки даже после ареста всех членов агентурной сети.